Nova tecnologia ajuda a revelar o funcionamento interno do genoma humano

NWCM, 23/06/2022 

Os pesquisadores da Weill Cornell Medicine e do New York Genome Center, em colaboração com a Oxford Nanopore Technologies, desenvolveram um novo método para avaliar em larga escala a estrutura tridimensional do genoma humano, ou como o genoma se dobra. O genoma é o conjunto completo de instruções genéticas, DNA ou RNA, que permitem que um organismo funcione.

Usando esse método, os pesquisadores demonstraram que a função celular, incluindo a expressão gênica, pode ser afetada por grupos de elementos reguladores que interagem simultaneamente no genoma, em vez de pares desses componentes. Suas descobertas, publicadas em 30 de maio na Nature Biotechnology, podem ajudar a esclarecer a relação entre a estrutura do genoma e a identidade celular.

Cientistas chineses restauram a visão em camundongos usando uma nova técnica de edição genética: PESpRY

IE, 17/03/2023 

Por Mert Erdemir 

A equipe de pesquisa usou um novo sistema de edição de genoma baseado em CRISPR chamado PESpRY.

Cientistas na China (comunista) trataram efetivamente a retinite pigmentosa, uma das principais causas de perda de visão, em camundongos, de acordo com um comunicado à imprensa publicado na Eurekalert.

Genoma (modificado) de peixe tem potencial para "melhorar a segurança alimentar"

NFM, 06/02/2023 

Por Grace Galler

Os pesquisadores dizem ter encontrado o “primeiro genoma de referência completo e de alta qualidade” para uma linhagem de tilápia geneticamente melhorada.

Pesquisadores do Earlham Institute, do Roslin Institute e do WorldFish afirmaram ter descoberto o primeiro genoma de referência completo e de alta qualidade para uma linhagem de tilápia geneticamente melhorada que, segundo eles, tem o potencial de melhorar a segurança alimentar em todo o mundo.

Sequência completa do cromossomo Y humano montada pela primeira vez

SCTD, 23/08/2023 

Nova sequência revela fatores genômicos na fertilidade, incluindo produção de esperma.

Uma equipe de pesquisa internacional gerou a primeira sequência verdadeiramente completa de um  cromossomo Y humano, o último cromossomo humano a ser totalmente sequenciado. A nova sequência, que preenche lacunas em mais de 50% do comprimento do cromossomo Y, revela importantes características genômicas com implicações para a fertilidade, como fatores na produção de esperma. O estudo, liderado pelo Consórcio Telomere-to-Telomere (T2T), uma equipe de pesquisadores financiada pelo National Human Genome Research Institute (NHGRI), parte dos National Institutes of Health, será publicado hoje (23 de agosto) na revista Nature.

Novo sistema de edição de genes CRISPR pode "arrastar e soltar" DNA em massa

NA, 24/11/2022 

Por Michael Irving 

Uma nova técnica foi adicionada à caixa de ferramentas de edição de genes CRISPR. Conhecido como PASTE, o sistema usa enzimas de vírus para “arrastar e soltar” grandes seções de DNA em um genoma, o que pode ajudar a tratar uma série de doenças genéticas.

O sistema CRISPR teve origem em bactérias, que o utilizavam como mecanismo de defesa contra vírus que as atacavam. Essencialmente, se uma bactéria sobrevivesse a uma infecção viral, ela usaria enzimas CRISPR para cortar um pequeno segmento do DNA do vírus e usá-lo para se lembrar de como combater futuras infecções desse vírus.

Enzimas baseadas em CRISPR modificadas melhoram a perspectiva de inserir genes inteiros no genoma

PHYS, 17/01/2023 

Por Noah Brown 

Muitas doenças genéticas são causadas por diversas mutações espalhadas por um gene inteiro, e projetar abordagens de edição do genoma para cada mutação do paciente seria impraticável e caro.

Investigadores do Massachusetts General Hospital (MGH) desenvolveram recentemente um método otimizado que melhora a precisão da inserção de grandes segmentos de DNA em um genoma.

Acelerando a edição primária: o Aprendizado de Máquina ajuda a projetar a melhor correção para uma determinada falha genética

SCTD, 17/02/2023 

Pesquisadores do Wellcome Sanger Institute desenvolveram uma nova ferramenta para prever as chances de inserir com sucesso uma sequência de DNA editada por um gene no genoma de uma célula, usando uma técnica conhecida como edição primária. Uma evolução da tecnologia de edição de genes CRISPR-Cas9, a edição primária tem um enorme potencial para tratar (ou criar) doenças genéticas em humanos, do câncer à fibrose cística. Mas até agora, os fatores que determinam o sucesso das edições não são bem compreendidos.

CRISPR – começar uma revolução não é o suficiente: confissões de uma eugenista

Jennifer A. Doudna

TA, 12/09/2022 

Por Jennifer A. Doudna 

O CRISPR está mudando o mundo, mas pode fazer mais.

Dois anos atrás, eu estava trabalhando no meu laptop em um saguão de aeroporto em Newark, Nova Jersey, quando olhei para cima e vi um casal andando com seus dois filhos. O menino mais novo caminhou lentamente de muletas, exibindo os sinais reveladores de uma doença hereditária chamada distrofia muscular. Geralmente manifestando-se na infância, a doença rouba constantemente daqueles que a têm a capacidade de andar. Eventualmente, eu sabia, as muletas não seriam mais suficientes.

Meu coração deu uma palpitada. A maioria dos tipos de distrofia muscular se origina de mutações genéticas que enfraquecem proteínas musculares-chave, e eu tinha acabado de chegar de uma reunião onde a cura parecia possível, usando a tecnologia CRISPR para reescrever o DNA de crianças como ele.

10 anos de edição do genoma CRISPR: Avanços, limitações e potencial futuro – Distopia

Fonte da imagem: New York Times

NML, 20/01/2023 

Na década desde a publicação do CRISPR-Cas9 como uma tecnologia de edição de genoma, a caixa de ferramentas CRISPR e seus aplicativos mudaram profundamente a pesquisa biológica, permitindo avanços por meio de aplicativos em plantas, animais e humanos. Em uma revisão, Joy Wang e Jennifer Doudna destacam 10 anos de edição do genoma CRISPR, discutindo os importantes avanços da técnica, limitações atuais e potencial promissor para o futuro.

Pesquisadores chineses usam tecnologia de edição genética para modificar e "melhorar" uma espécie de repolho

PHYS, 30/10/2023 

CRISPR/Cas9 desbloqueia resistência ao TuMV no repolho chinês: um salto em frente no melhoramento genético de plantas editadas pelo genoma

A edição do genoma, especialmente a tecnologia CRISPR/Cas9, é imensamente promissora no aprimoramento das características das plantas, principalmente na resistência a doenças, oferecendo uma alternativa mais eficiente ao melhoramento tradicional.

O vírus do mosaico do nabo (TuMV), um tipo de potyvírus, ameaça gravemente as culturas de couve chinesa (Brassica rapa). A pesquisa existente sugere que os genes do fator de iniciação da tradução eucariótica (eIF), como o eIF (iso) 4E, desempenham um papel fundamental na resistência ao TuMV em Arabidopsis.

Como os dados genômicos estão impulsionando a saúde na Estônia: distopia genética

VB, 12/10/2022 

Por George Lawton 

A medicina genômica tem o poder de transformar e personalizar a experiência de saúde. No entanto, apesar dessa tremenda promessa, os dados genômicos normalmente são usados ​​apenas fora dos fluxos de trabalho de rotina de saúde para tratar doenças raras ou priorizar o diagnóstico de câncer. As organizações de saúde enfrentam desafios para garantir a privacidade dos dados genômicos em vários fluxos de trabalho. Além disso, a maioria dos médicos não foi treinada para interpretar o significado dos resultados genômicos nas opções de tratamento e comunicá-los aos pacientes. 

Cientista chinês que afirmou ter editado bebês inicia um novo laboratório em Pequim

BTB, 07/02/2023 

Por John Hayward 

O cientista chinês He Jiankui, que desapareceu da vista do público logo após anunciar que havia editado os genes de três bebês humanos em 2018 e 2019, deu uma entrevista ao South China Morning Post (SCMP) na sexta-feira.

Ele disse que esperava que as crianças com as quais ele fez os experimentos não fossem incomodadas com muitas demandas de análise científica.

Cientistas elaboram batata geneticamente modificada resistente ao clima e para "melhor nutrição"

FIF, 01/09/2023 

Por Jolanda Van Hal 

Elaborando uma super batata: pesquisadores preparam o terreno para uma batata resistente ao clima preparada para melhorar a nutrição

01 de setembro de 2023 --- Os cientistas criaram um super pangenoma que captura a diversidade genética completa de várias espécies de batata, para identificar características genéticas que podem ajudar a melhorar sua resiliência e qualidade nutricional. Os pesquisadores analisaram dados de bancos de dados públicos, incluindo bancos de genes no Canadá, nos EUA e no Peru. 

Pesquisadores desenvolvem bactérias da pele capazes de secretar e produzir moléculas que tratam a acne

PHYS, 09/01/2024 

Uma pesquisa internacional liderada pelo Laboratório de Biologia Sintética Translacional do Departamento de Medicina e Ciências da Vida (MELIS), ​​da Universidade Pompeu Fabra, conseguiu projetar com eficiência Cutibacterium acnes, um tipo de bactéria da pele, para produzir e secretar uma molécula terapêutica adequada para tratar sintomas de acne.

A bactéria projetada foi validada em linhagens de células da pele e sua entrega foi validada em camundongos. Esta descoberta abre a porta para ampliar o caminho para a engenharia de bactérias não tratáveis ​​para tratar alterações da pele e outras doenças usando terapêuticas vivas.

Treinamento de IA: uma foto de gato ao contrário ainda é uma foto de gato

TX, 04/05/2023 

Os genes constituem apenas uma pequena fração do genoma humano. Entre eles estão amplas sequências de DNA que direcionam as células quando, onde e quanto cada gene deve ser usado. Esses manuais de instrução biológica são conhecidos como motivos regulatórios. Se isso soa complexo, bem, é.

As instruções para a regulação dos genes são escritas em um código complicado, e os cientistas recorreram à inteligência artificial para decifrá-lo. Para aprender as regras da regulação do DNA, eles estão usando redes neurais profundas (DNNs), que se destacam em encontrar padrões em grandes conjuntos de dados. Os DNNs estão no centro de ferramentas populares de IA, como o ChatGPT. Graças a uma nova ferramenta desenvolvida pelo professor assistente do Laboratório Cold Spring Harbor, Peter Koo, os DNNs de análise de genoma agora podem ser treinados com muito mais dados do que os obtidos apenas por meio de experimentos.

O próximo passo para a tecnologia CRISPR: edição de genes para as massas?

MTTR, 19/01/2023 

Por Jessica Hamzelou 

No ano passado, a Verve Therapeutics iniciou o primeiro teste em humanos de um tratamento CRISPR que poderia beneficiar a maioria das pessoas – um sinal de que a edição de genes pode estar pronta para se tornar popular.

Já sabemos o básico de uma vida saudável. Uma dieta balanceada, exercícios regulares e redução do estresse podem nos ajudar a evitar doenças cardíacas – a maior causa de morte no mundo. Mas e se você também pudesse tomar uma vacina? E não uma vacina típica – uma injeção que alteraria seu DNA para fornecer proteção vitalícia? 

Como o CRISPR pode ajudar a "salvar" (modificar) as plantações da devastação causada por pragas

Fonte da imagem: C&en

MITTR, 02/02/2023 

Os insetos que editam genes podem ajudar a reduzir a dependência de pesticidas – e ajudar a proteger indústrias bilionárias.

O produtor de uvas da Califórnia central, Steve McIntyre, estava familiarizado com a doença de Pierce. Mas isso não o preparou para o que viu quando visitou a fazenda de frutas cítricas e abacates de seu irmão no sul da Califórnia em 1998. A doença, que faz com que as vinhas murchem e as uvas murchem como balões velhos, existia há muito tempo na Califórnia. Mas a infecção que ele viu em uma fazenda adjacente à propriedade de seu irmão parecia diferente. 

Eugenia – esqueça os bebês desenhados: Veja como o CRISPR está realmente "mudando vidas"

MITTR, 07/03/2023 

Por Antonio Regalado

A ferramenta de edição genética está sendo testada em pessoas, e o primeiro tratamento pode ser aprovado este ano.

Esqueça He Jiankui, o cientista chinês que criou bebês geneticamente modificados. Em vez disso, quando você pensa em edição de genes, deve pensar em Victoria Gray, a mulher afro-americana que diz ter sido curada dos sintomas da doença falciforme. 

Cientistas modificam geneticamente com sucesso células individuais em animais vivos

SCTD, 24/09/2023 

Um método comprovado para rastrear as origens genéticas das doenças e eliminar um único gene em animais e estudar as consequências que isso tem para o organismo. O problema é que, para muitas doenças, a patologia é determinada por múltiplos genes, complicando a tarefa dos cientistas que tentam identificar a contribuição de qualquer gene único para a doença. Para fazer isso, eles teriam que realizar muitos experimentos em animais – um para cada modificação genética desejada.

Pesquisadores liderados por Randall Platt, professor de Engenharia Biológica no Departamento de Ciência e Engenharia de Biossistemas da ETH Zurich em Basileia, desenvolveram agora um método que irá simplificar e acelerar bastante a pesquisa com animais de laboratório: usando a tesoura genética CRISPR-Cas, eles fazem simultaneamente várias dezenas de alterações genéticas nas células de um único animal, como um mosaico.

Os modelos de linguagem conseguem ler o genoma? Este aqui decodificou o mRNA para criar vacinas melhores

PHYS, 06/04/2024 

A mesma classe de inteligência artificial que ganhou manchetes codificando software e passando no exame da ordem aprendeu a ler um tipo diferente de texto—o código genético.

Esse código contém instruções para todas as funções da vida e segue regras não muito diferentes das que regem as línguas humanas. Cada sequência no genoma adere a uma gramática e sintaxe intrincadas, as estruturas que dão origem ao significado. Assim como mudar algumas palavras pode alterar radicalmente o impacto de uma frase, pequenas variações em uma sequência biológica podem fazer uma enorme diferença nas formas que essa sequência codifica.