IA espera desvendar segredos de genes não codificadores

PHYS, 15/05/2024 

Dos chatbots inteligentes a aplicativos que podem escrever artigos inteiros, a Inteligência Artificial (IA) está se tornando uma parte cada vez mais ubíqua de nossas vidas. Michael Schon, um associado de pesquisa da Universidade e Pesquisa de Wageningen, está projetando uma ferramenta de IA que pode realizar comparações de RNA não codificadores em genomas de plantas. A ferramenta deve acelerar e simplificar o desenvolvimento futuro de novas variedades de plantas com maior resistência à seca ou doenças, por exemplo.

Proteínas são os blocos de construção para células em organismos. As instruções para fazer essas proteínas são emitidas (codificadas) por RNA de genes. Ao lado desses RNAs codificadores, alguns genes podem produzir RNAs não codificadores: em outras palavras, RNA que não inclui instruções para fazer uma proteína.

Ah, ótimo, a inteligência artificial agora pode mexer com nosso DNA

NA, 24/04/2024 

Por Michael Franco 

Medicamente, a IA está nos ajudando com tudo, desde identificar ritmos cardíacos anormais antes que ocorram até detectar câncer de pele. Mas será que realmente precisamos que ela se envolva com nosso genoma? A empresa de design de proteínas Profluent acredita que sim.

Fundada em 2022 em Berkeley, Califórnia, a Profluent vem explorando maneiras de usar a IA para estudar e gerar novas proteínas que não são encontradas na natureza. Esta semana, a equipe comemorou um grande sucesso com o lançamento de uma proteína derivada da IA chamada OpenCRISPR-1.

Os modelos de linguagem conseguem ler o genoma? Este aqui decodificou o mRNA para criar vacinas melhores

PHYS, 06/04/2024 

A mesma classe de inteligência artificial que ganhou manchetes codificando software e passando no exame da ordem aprendeu a ler um tipo diferente de texto—o código genético.

Esse código contém instruções para todas as funções da vida e segue regras não muito diferentes das que regem as línguas humanas. Cada sequência no genoma adere a uma gramática e sintaxe intrincadas, as estruturas que dão origem ao significado. Assim como mudar algumas palavras pode alterar radicalmente o impacto de uma frase, pequenas variações em uma sequência biológica podem fazer uma enorme diferença nas formas que essa sequência codifica.

Cientistas propõem hackear vírus para combater as mudanças climáticas

TB, 19/02/2024 

Por Noor Al-Sibai 

É uma armadilha!

A água do oceano e o gelo ártico podem conter vírus que podem ajudar a aprisionar as emissões de carbono – e os cientistas estão descobrindo maneiras de aprimorá-los.

Como um comunicado de imprensa da Universidade Estadual de Ohio sobre a nova pesquisa explica, os cientistas começaram a tentar identificar vírus que poderiam ajudar a mitigar os piores efeitos das mudanças climáticas, alguns aprisionando carbono na água do mar e outros impedindo o vazamento de metano do permafrost derretendo.

Pesquisador sugere "Vigilância Genômica Global" para detectar o surgimento de superbactérias

SCTD, 28/10/2023 

Aproveitar novos avanços na tecnologia de vigilância genômica poderia ajudar a detectar o aumento de “superbactérias” mortais.

Aproveitar novos avanços na tecnologia de vigilância genômica poderia ajudar a detectar o aumento de “superbactérias” mortais e a retardar a sua evolução e propagação, melhorando os resultados da saúde global, sugere um novo estudo australiano.

A resistência antimicrobiana ocorre quando bactérias, vírus, fungos e parasitas mudam ao longo do tempo e não respondem mais aos medicamentos e produtos químicos que usamos para matá-los. Estas “superbactérias” tornam as infecções mais difíceis de tratar e aumentam o risco de propagação de doenças, doenças graves e morte.

Cientistas constroem um sistema que pode gerar modelos de IA para pesquisa em biologia

TX, 07/07/2023 

Por Alex Ouyang 

É possível construir modelos de aprendizado de máquina sem experiência em aprendizado de máquina?

Jim Collins, o Termeer Professor de Engenharia Médica e Ciências no Departamento de Engenharia Biológica do MIT, e o corpo docente de ciências biológicas da Abdul Latif Jameel Clinic for Machine Learning in Health (Jameel Clinic), juntamente com vários colegas decidiram abordar este problema ao enfrentar um enigma semelhante. Um artigo de acesso aberto sobre a solução proposta, chamado BioAutoMATED, foi publicado na Cell Systems.

IA combinada com CRISPR controla com precisão a expressão gênica: Eugenia e Transumanismo

PHYS, 03/07/2023 

A inteligência artificial pode prever a atividade dentro e fora do alvo das ferramentas CRISPR que visam o RNA em vez do DNA, de acordo com uma nova pesquisa publicada na Nature Biotechnology.

O estudo de pesquisadores da Universidade de Nova York, da Universidade de Columbia e do New York Genome Center combina um modelo de aprendizado profundo com telas CRISPR, para controlar a expressão de genes humanos de diferentes maneiras – como apertar um interruptor de luz para desligá-los completamente ou usando um botão dimmer para diminuir parcialmente a atividade. Esses controles genéticos precisos podem ser usados ​​para desenvolver novas terapias baseadas em CRISPR.

Pesquisadores criam embriões humanos sintéticos sem esperma ou óvulos

ZH, 17/06/2023 - com Epoch Times

Por Tyler Durden 

Cientistas criaram embriões humanos sintéticos a partir de células-tronco sem o uso de óvulos ou esperma em um desenvolvimento que levanta questões morais e legais desafiadoras.

Os embriões sintéticos, também conhecidos como modelos de embriões, não são iguais aos embriões humanos reais. Em vez disso, eles se parecem com os estágios iniciais do desenvolvimento humano e não mostram sinais do início de um cérebro ou de um coração pulsante. No entanto, contém células que normalmente acabam formando a placenta, o saco vitelino e o embrião. O desenvolvimento de embriões humanos sintéticos foi revelado na reunião anual da Sociedade Internacional para Pesquisa de Células-Tronco em Boston, na quarta-feira, pela professora Magdalena Zernicka-Goetz, da Universidade de Cambridge e do Instituto de Tecnologia da Califórnia.

Treinamento de IA: uma foto de gato ao contrário ainda é uma foto de gato

TX, 04/05/2023 

Os genes constituem apenas uma pequena fração do genoma humano. Entre eles estão amplas sequências de DNA que direcionam as células quando, onde e quanto cada gene deve ser usado. Esses manuais de instrução biológica são conhecidos como motivos regulatórios. Se isso soa complexo, bem, é.

As instruções para a regulação dos genes são escritas em um código complicado, e os cientistas recorreram à inteligência artificial para decifrá-lo. Para aprender as regras da regulação do DNA, eles estão usando redes neurais profundas (DNNs), que se destacam em encontrar padrões em grandes conjuntos de dados. Os DNNs estão no centro de ferramentas populares de IA, como o ChatGPT. Graças a uma nova ferramenta desenvolvida pelo professor assistente do Laboratório Cold Spring Harbor, Peter Koo, os DNNs de análise de genoma agora podem ser treinados com muito mais dados do que os obtidos apenas por meio de experimentos.

Uma IA criou robôs a partir de tecidos vivos. Então eles começaram a se reproduzir…. Conheça os xenobots

SF, 08/04/2023 

Por Hayley Bennett 

Os cientistas estão usando materiais vivos para fazer máquinas que alguns considerariam vivas... e agora eles começaram a replicar

Quando pensamos em um robô, o que geralmente vem à mente é algum tipo de servo sintético – uma máquina revestida de metal controlada por eletrônicos. Embora possa fazer tarefas para nós e talvez até falar conosco de maneiras que parecem inteligentes, não o consideraríamos vivo.

Modelo de linguagem alimentado por IA gera sequências de proteínas funcionais

IE, 31/01/2023

Por Jijo Malayil 

A primeira vez que um modelo de linguagem foi usado para sintetizar proteínas humanas. 

Ultimamente, os modelos de IA estão realmente flexionando seus músculos. Vimos recentemente como o ChatGPT se tornou um garoto-propaganda para plataformas que compreendem idiomas humanos. Agora, uma equipe de pesquisadores testou um modelo de linguagem para criar sequências de aminoácidos, mostrando habilidades para replicar a biologia e a evolução humana. 

A mais nova IA da Meta determina dobras de proteínas adequadas 60 vezes mais rápido

EGT, 01/11/2022 

Por A Tarantola 

A vida na Terra não existiria como a conhecemos, se não fosse pelas moléculas de proteína que permitem processos críticos desde a fotossíntese e degradação enzimática até a visão e nosso sistema imunológico. E como a maioria das facetas do mundo natural, a humanidade está apenas começando a descobrir as multidões de tipos de proteínas que realmente existem. Mas, em vez de vasculhar as partes mais inóspitas do planeta em busca de novos microrganismos que possam ter um novo sabor de molécula orgânica, os pesquisadores da Meta desenvolveram um banco de dados metagenômico inédito, o ESM Metagenomic Atlas, que poderia acelerar a proteína existente — dobrando o desempenho da IA ​​em 60x.

Como a WhiteLab Genomics está usando a IA para ajudar no desenvolvimento de terapia genética e celular

YF, 13/09/2022 

Por Paul Sawers 

A empresa francesa de biotecnologia WhiteLab Genomics levantou US$ 10 milhões em financiamento para uma plataforma de IA projetada para ajudar na descoberta e desenvolvimento de terapias genômicas.

Fundada em Paris em 2019, a recém -formada em Y Combinator (YC) WhiteLab Genomics fornece às empresas de terapia genética e celular simulações de software preditivas para agilizar o projeto de terapias genéticas e celulares. A terapia genética, para os não iniciados, é um tratamento emergente que envolve a substituição de genes ausentes ou defeituosos nas células para corrigir distúrbios genéticos, enquanto a terapia celular trata de alterar uma célula ou conjuntos de células para desencadear um efeito em todo o corpo.

Empresa chinesa Epigenic Therapeutics levanta US$ 20 milhões para tecnologia de edição genética

LT, 08/08/2022 

Por Jim Cornall 

A Epigenic Therapeutics Co., Ltd., uma empresa chinesa de edição de genes de biotecnologia, garantiu US$ 20 milhões em financiamento Series Angel e Pre-A. 

O financiamento da Série Pre-A veio de investimentos da Morningside Venture Capital, Kingray Capital, Trinity Innovation Fund e TigerYeah Capital. O investidor anjo FountainBridge Capital também está participando.

Os recursos serão usados ​​para promover a edição epigenética da empresa em primatas não humanos, expandir conhecimentos e capacidades e patrocinar investigações clínicas em estágio inicial.